Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ncbp3-201ENSMUST00000021135 12106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Steap4-201ENSMUST00000115421 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Hnf4g-201ENSMUST00000108393 2224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ncoa6-202ENSMUST00000109669 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm38030-201ENSMUST00000192376 475 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Bdnf-202ENSMUST00000111042 3905 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm42519-201ENSMUST00000199282 3656 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm15128-201ENSMUST00000112814 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Xlr3a-202ENSMUST00000114524 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1259-202ENSMUST00000214846 4325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Tmem19-209ENSMUST00000219890 2949 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Foxp2-205ENSMUST00000115474 2544 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Lrrc43Q3V0L5 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1a-202ENSMUST00000114666 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm12236-201ENSMUST00000152968 250 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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Lrrc43Q3V0L5 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Lrrc43Q3V0L5 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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