Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6I4

USP3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, humanhuman

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3Q9Y6I4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP3Q9Y6I4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
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