Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTNAP2Q9UHC6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms