Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXF1Q9UBU9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXF1Q9UBU9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms