Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stx6Q9JKK1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stx6Q9JKK1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms