Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl28Q9D1B9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms