Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
C9orf16Q9BUW7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C9orf16Q9BUW7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms