Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARXQ96QS3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARXQ96QS3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
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