Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEMA6DQ8NFY4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEMA6DQ8NFY4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms