Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf2Q7TMI3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf2Q7TMI3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms