Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q71RC1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q71RC1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q71RC1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q71RC1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q71RC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q71RC1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q71RC1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q71RC1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q71RC1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q71RC1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q71RC1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q71RC1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q71RC1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms