Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl35Q6ZWV7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl35Q6ZWV7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms