Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1orf220Q5T0J3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1orf220Q5T0J3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms