Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930567H17RikQ3V0K5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930567H17RikQ3V0K5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms