Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9Z9

Zufsp, Zinc finger with UFM1-specific peptidase domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZufspQ3T9Z9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZufspQ3T9Z9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZufspQ3T9Z9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZufspQ3T9Z9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZufspQ3T9Z9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZufspQ3T9Z9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZufspQ3T9Z9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZufspQ3T9Z9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms