Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDC16Q13042 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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