Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 YOR082CYOR082C 342 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-GR3Q12316 VID24YBR105C 1089 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-GR3Q12316 PIN4YBL051C 2007 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-GR3Q12316 VPS9YML097C 1356 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-GR3Q12316 YCR007CYCR007C 720 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 HUB1YNR032C-A 222 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 GAL7YBR018C 1101 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YGL262WYGL262W 528 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 URM1YIL008W 300 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 PLM2YDR501W 1566 nt1.14□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 ERD2YBL040C 660 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 IAH1YOR126C 717 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 COG1YGL223C 1254 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 HMS1YOR032C 1305 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 LEU3YLR451W 2661 nt1.13□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 IRC3YDR332W 2070 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 TIM21YGR033C 720 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 MCR1YKL150W 909 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YNL234WYNL234W 1281 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 TBS1YBR150C 3285 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 MUS81YDR386W 1899 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 RED1YLR263W 2484 nt1.12□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YER066C-AYER066C-A 501 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 SEC4YFL005W 648 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 EBP2YKL172W 1284 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YNL143CYNL143C 393 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YOR263CYOR263C 408 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 TFB1YDR311W 1929 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YLR108CYLR108C 1458 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 RAD9YDR217C 3930 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 RPS17BYDR447C 411 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 RPS26BYER131W 360 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 RIO2YNL207W 1278 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 APD1YBR151W 951 nt1.11□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 SSP1YHR184W 1716 nt1.1□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YGR015CYGR015C 987 nt1.1□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 RSR1YGR152C 819 nt1.1□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 SET3YKR029C 2256 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 STN1YDR082W 1485 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YPR148CYPR148C 1308 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 APL3YBL037W 3078 nt1.09□□□□□ -2.23
TY1B-GR3Q12316 YBR138CYBR138C 1575 nt1.09□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 RIT1YMR283C 1542 nt1.09□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 TAH1YCR060W 336 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 CDC36YDL165W 576 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 BSC2YDR275W 708 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 MTG1YMR097C 1104 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YCL068CYCL068C 783 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YKL069WYKL069W 543 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 ATP22YDR350C 2055 nt1.08□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YER137C-AYER137C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YER159C-AYER159C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YJR026WYJR026W 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YJR028WYJR028W 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YAR010CYAR010C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YML040WYML040W 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YML045W-AYML045W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YMR051CYMR051C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YGR026WYGR026W 837 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 NOP19YGR251W 591 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YOR062CYOR062C 807 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 SEC59YMR013C 1560 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 CAT2YML042W 2013 nt1.07□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YDR124WYDR124W 975 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 TIM11YDR322C-A 291 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 EMC2YJR088C 879 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 AI1Q0050 2505 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 SPR3YGR059W 1539 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 RPL16AYIL133C 600 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YJL202CYJL202C 348 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 SMD3YLR147C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YOL114CYOL114C 609 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YBR096WYBR096W 693 nt1.06□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 SRP1YNL189W 1629 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 CTK1YKL139W 1587 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 CLC1YGR167W 702 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.05□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 APL1YJR005W 2103 nt1.04□□□□□ -2.24
TY1B-GR3Q12316 MPS1YDL028C 2295 nt1.04□□□□□ -2.24
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