Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MCCD1P59942 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCCD1P59942 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms