Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK2P49760 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK2P49760 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK2P49760 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK2P49760 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK2P49760 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK2P49760 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK2P49760 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK2P49760 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK2P49760 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK2P49760 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms