Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HOXA9P31269 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXA9P31269 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms