Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LCHNA4D1U4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms