Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Odf2A3KGV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms