Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM89A2RUT3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM89A2RUT3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms