Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HMX2A2RU54 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms