Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DYNC1LI1Q9Y6G9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms