Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Q9Y3F1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms