Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A4Q9NY91 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A4Q9NY91 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms