Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fip1l1Q9D824 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fip1l1Q9D824 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms