Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nkiras2Q9CR56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nkiras2Q9CR56 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms