Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC191Q8NCU4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC191Q8NCU4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC191Q8NCU4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC191Q8NCU4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms