Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup62Q63850 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup62Q63850 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms