Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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KRTAP13-3Q3SY46 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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KRTAP13-3Q3SY46 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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KRTAP13-3Q3SY46 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-3Q3SY46 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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