Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 ALG14YBR070C 714 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 IRC16YPR038W 360 nt3.1□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 LCB4YOR171C 1875 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 SIZ1YDR409W 2715 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 BMH2YDR099W 822 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 HMF1YER057C 390 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YER135CYER135C 393 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 TPM2YIL138C 486 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 IRC19YLL033W 693 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 OST6YML019W 999 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 CMC2YBL059C-A 330 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 RSM19YNR037C 276 nt3.09□□□□□ -1.91
LCB4Q12246 YDL180WYDL180W 1644 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YCG1YDR325W 3108 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SEA4YBL104C 3117 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 MGT1YDL200C 567 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 VFA1YER128W 612 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 PET54YGR222W 882 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YHR125WYHR125W 306 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 TVP18YMR071C 504 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RRD2YPL152W 1077 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SET1YHR119W 3243 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 STT4YLR305C 5703 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 GYL1YMR192W 2163 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.08□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 HEH2YDR458C 1992 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 LIF1YGL090W 1266 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 BET3YKR068C 582 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SRL3YKR091W 741 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YBR012CYBR012C 420 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 TLC1TLC1 1301 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 ALY1YKR021W 2748 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YMR018WYMR018W 1545 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 VAC8YEL013W 1737 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 ETP1YHL010C 1758 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SLP1YOR154W 1764 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 EMP70YLR083C 2004 nt3.07□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 KHA1YJL094C 2622 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RPS26BYER131W 360 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RPB9YGL070C 369 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YHR138CYHR138C 345 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 DLS1YJL065C 504 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RMP1YLR145W 606 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 CDC123YLR215C 1083 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YLR302CYLR302C 363 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YML084WYML084W 309 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YNL058CYNL058C 951 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RPL23AYBL087C 414 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 PFY1YOR122C 381 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YOR392WYOR392W 444 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YPR077CYPR077C 372 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 CHS2YBR038W 2892 nt3.06□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 GCN1YGL195W 8019 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 ARK1YNL020C 1917 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 CSR2YPR030W 3366 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 STP2YHR006W 1626 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SPE1YKL184W 1401 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SWF1YDR126W 1011 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SMB1YER029C 591 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YLR269CYLR269C 351 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 HFM1YGL251C 3564 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 VBA4YDR119W 2307 nt3.05□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 URB2YJR041C 3525 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 LSM8YJR022W 330 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YLR230WYLR230W 306 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 COX14YML129C 213 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 HHF2YNL030W 312 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 HHT2YNL031C 411 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YNL179CYNL179C 438 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 HEM4YOR278W 828 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SRC1YML034W 2505 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 SKN7YHR206W 1869 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 MES1YGR264C 2256 nt3.04□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 DAS1YJL149W 1992 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 STN1YDR082W 1485 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 MNT3YIL014W 1893 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 POL2YNL262W 6669 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YER038W-AYER038W-A 381 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 GLC7YER133W 939 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 TCD1YHR003C 1290 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 NGL1YOL042W 1092 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YOL150CYOL150C 312 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YPL034WYPL034W 498 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RPS23BYPR132W 438 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 YBR285WYBR285W 435 nt3.03□□□□□ -1.92
LCB4Q12246 RSE1YML049C 4086 nt3.03□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YHR080CYHR080C 4038 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YSP2YDR326C 4317 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 RPN1YHR027C 2982 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 MSH2YOL090W 2895 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 ATG31YDR022C 591 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 NBL1YHR199C-A 222 nt3.02□□□□□ -1.93
LCB4Q12246 MRPL38YKL170W 417 nt3.02□□□□□ -1.93
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