Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn1Q08091 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn1Q08091 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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