Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps28P62858 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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