Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tac1P41539 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tac1P41539 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tac1P41539 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms