Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PBX3P40426 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PBX3P40426 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PBX3P40426 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX3P40426 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX3P40426 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PBX3P40426 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms