Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Saa4P31532 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Saa4P31532 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Saa4P31532 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Saa4P31532 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Saa4P31532 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms