Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cbx3P23198 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms