Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rpl13aP19253 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rpl13aP19253 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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