Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAPN2P17655 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAPN2P17655 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms