Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MS4A1P11836 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MS4A1P11836 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms