Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc28a2O88627 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc28a2O88627 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms