Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Gm379J3QQ19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm379J3QQ19 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Gm379J3QQ19 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm379J3QQ19 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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