Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r167G3UW71 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r167G3UW71 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r167G3UW71 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms