Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SRRM3A6NNA2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms