Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SYNDIG1LA6NDD5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms