Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trem1Q9JKE2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trem1Q9JKE2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms