Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CWC22Q9HCG8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CWC22Q9HCG8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms