Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc97Q9DBT3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc97Q9DBT3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms